Barnabas İncili ile ilgili olarak birçok araştırmacı, çok ciddi iddialar ortaya atıyor. Araştırmacılar, Barnabas İncili'nin arka yüzünün çok karanlık ve kanlı olduğunu söylüyor. Yapılan iddialara göre; Hristiyan dünyası bu İncil'in yayılmaması için akıl almaz yöntemlere başvuruyor. Abdullah Çatlı'dan Muhsin Yazıcıoğlu'na kadar birçok kişinin ölümünün perde arkasında bu İncil yatıyor. Barnabas İncili'ni görüp, okuyan herkesin öldürüldüğü konusunda ortada çok fazla iddia var. Anlaşılan bu İncil, tam anlamıyla gün yüzüne çıkıp, Hristiyanlık büyük bir itibar kaybetmediği sürece çok büyük kayıplar verilecek.